Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYW4

Hdhd3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdhd3Q9CYW4 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hdhd3Q9CYW4 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms