Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYC3

Tmem39a, Transmembrane protein 39A, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem39aQ9CYC3 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem39aQ9CYC3 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem39aQ9CYC3 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem39aQ9CYC3 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem39aQ9CYC3 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem39aQ9CYC3 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem39aQ9CYC3 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem39aQ9CYC3 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem39aQ9CYC3 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem39aQ9CYC3 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem39aQ9CYC3 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem39aQ9CYC3 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem39aQ9CYC3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem39aQ9CYC3 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem39aQ9CYC3 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem39aQ9CYC3 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem39aQ9CYC3 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem39aQ9CYC3 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem39aQ9CYC3 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem39aQ9CYC3 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem39aQ9CYC3 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem39aQ9CYC3 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem39aQ9CYC3 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem39aQ9CYC3 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem39aQ9CYC3 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem39aQ9CYC3 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem39aQ9CYC3 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem39aQ9CYC3 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem39aQ9CYC3 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem39aQ9CYC3 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem39aQ9CYC3 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem39aQ9CYC3 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem39aQ9CYC3 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem39aQ9CYC3 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem39aQ9CYC3 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem39aQ9CYC3 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem39aQ9CYC3 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem39aQ9CYC3 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem39aQ9CYC3 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem39aQ9CYC3 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem39aQ9CYC3 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem39aQ9CYC3 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem39aQ9CYC3 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem39aQ9CYC3 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem39aQ9CYC3 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem39aQ9CYC3 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem39aQ9CYC3 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem39aQ9CYC3 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem39aQ9CYC3 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem39aQ9CYC3 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem39aQ9CYC3 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem39aQ9CYC3 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem39aQ9CYC3 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem39aQ9CYC3 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem39aQ9CYC3 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem39aQ9CYC3 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem39aQ9CYC3 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem39aQ9CYC3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem39aQ9CYC3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem39aQ9CYC3 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem39aQ9CYC3 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem39aQ9CYC3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem39aQ9CYC3 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem39aQ9CYC3 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem39aQ9CYC3 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem39aQ9CYC3 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem39aQ9CYC3 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem39aQ9CYC3 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem39aQ9CYC3 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem39aQ9CYC3 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem39aQ9CYC3 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem39aQ9CYC3 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem39aQ9CYC3 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem39aQ9CYC3 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem39aQ9CYC3 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem39aQ9CYC3 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem39aQ9CYC3 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem39aQ9CYC3 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem39aQ9CYC3 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem39aQ9CYC3 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem39aQ9CYC3 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem39aQ9CYC3 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem39aQ9CYC3 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem39aQ9CYC3 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem39aQ9CYC3 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem39aQ9CYC3 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem39aQ9CYC3 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem39aQ9CYC3 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem39aQ9CYC3 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem39aQ9CYC3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem39aQ9CYC3 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem39aQ9CYC3 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem39aQ9CYC3 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem39aQ9CYC3 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem39aQ9CYC3 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem39aQ9CYC3 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem39aQ9CYC3 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem39aQ9CYC3 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem39aQ9CYC3 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem39aQ9CYC3 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms