Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX9

Ddx47, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx47Q9CWX9 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ddx47Q9CWX9 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ddx47Q9CWX9 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ddx47Q9CWX9 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddx47Q9CWX9 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddx47Q9CWX9 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddx47Q9CWX9 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddx47Q9CWX9 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddx47Q9CWX9 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddx47Q9CWX9 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddx47Q9CWX9 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddx47Q9CWX9 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddx47Q9CWX9 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddx47Q9CWX9 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddx47Q9CWX9 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddx47Q9CWX9 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
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Ddx47Q9CWX9 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddx47Q9CWX9 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddx47Q9CWX9 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Ddx47Q9CWX9 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddx47Q9CWX9 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddx47Q9CWX9 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Ddx47Q9CWX9 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Ddx47Q9CWX9 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddx47Q9CWX9 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddx47Q9CWX9 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddx47Q9CWX9 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddx47Q9CWX9 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddx47Q9CWX9 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddx47Q9CWX9 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddx47Q9CWX9 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddx47Q9CWX9 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddx47Q9CWX9 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddx47Q9CWX9 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddx47Q9CWX9 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Ddx47Q9CWX9 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddx47Q9CWX9 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddx47Q9CWX9 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddx47Q9CWX9 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddx47Q9CWX9 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddx47Q9CWX9 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddx47Q9CWX9 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddx47Q9CWX9 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Ddx47Q9CWX9 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Ddx47Q9CWX9 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Ddx47Q9CWX9 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddx47Q9CWX9 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Ddx47Q9CWX9 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddx47Q9CWX9 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Ddx47Q9CWX9 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddx47Q9CWX9 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddx47Q9CWX9 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddx47Q9CWX9 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddx47Q9CWX9 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddx47Q9CWX9 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddx47Q9CWX9 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddx47Q9CWX9 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddx47Q9CWX9 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddx47Q9CWX9 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddx47Q9CWX9 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddx47Q9CWX9 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddx47Q9CWX9 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddx47Q9CWX9 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddx47Q9CWX9 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddx47Q9CWX9 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddx47Q9CWX9 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ddx47Q9CWX9 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ddx47Q9CWX9 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ddx47Q9CWX9 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ddx47Q9CWX9 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ddx47Q9CWX9 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ddx47Q9CWX9 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ddx47Q9CWX9 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ddx47Q9CWX9 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ddx47Q9CWX9 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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