Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxxc1Q9CWW7 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxxc1Q9CWW7 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxxc1Q9CWW7 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxxc1Q9CWW7 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxxc1Q9CWW7 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxxc1Q9CWW7 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxxc1Q9CWW7 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxxc1Q9CWW7 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxxc1Q9CWW7 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxxc1Q9CWW7 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxxc1Q9CWW7 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxxc1Q9CWW7 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxxc1Q9CWW7 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxxc1Q9CWW7 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxxc1Q9CWW7 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxxc1Q9CWW7 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxxc1Q9CWW7 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxxc1Q9CWW7 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxxc1Q9CWW7 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxxc1Q9CWW7 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxxc1Q9CWW7 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxxc1Q9CWW7 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxxc1Q9CWW7 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxxc1Q9CWW7 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxxc1Q9CWW7 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxxc1Q9CWW7 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxxc1Q9CWW7 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxxc1Q9CWW7 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxxc1Q9CWW7 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxxc1Q9CWW7 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxxc1Q9CWW7 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxxc1Q9CWW7 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxxc1Q9CWW7 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxxc1Q9CWW7 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxxc1Q9CWW7 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxxc1Q9CWW7 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxxc1Q9CWW7 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxxc1Q9CWW7 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxxc1Q9CWW7 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxxc1Q9CWW7 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxxc1Q9CWW7 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxxc1Q9CWW7 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxxc1Q9CWW7 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxxc1Q9CWW7 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxxc1Q9CWW7 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxxc1Q9CWW7 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxxc1Q9CWW7 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxxc1Q9CWW7 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxxc1Q9CWW7 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxxc1Q9CWW7 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxxc1Q9CWW7 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxxc1Q9CWW7 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Cxxc1Q9CWW7 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxxc1Q9CWW7 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxxc1Q9CWW7 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Cxxc1Q9CWW7 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Cxxc1Q9CWW7 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Cxxc1Q9CWW7 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxxc1Q9CWW7 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxxc1Q9CWW7 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Cxxc1Q9CWW7 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxxc1Q9CWW7 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxxc1Q9CWW7 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxxc1Q9CWW7 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxxc1Q9CWW7 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxxc1Q9CWW7 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxxc1Q9CWW7 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxxc1Q9CWW7 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxxc1Q9CWW7 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxxc1Q9CWW7 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxxc1Q9CWW7 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxxc1Q9CWW7 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxxc1Q9CWW7 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cxxc1Q9CWW7 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cxxc1Q9CWW7 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cxxc1Q9CWW7 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cxxc1Q9CWW7 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cxxc1Q9CWW7 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cxxc1Q9CWW7 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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