Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnot11Q9CWN7 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnot11Q9CWN7 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnot11Q9CWN7 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnot11Q9CWN7 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnot11Q9CWN7 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnot11Q9CWN7 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnot11Q9CWN7 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cnot11Q9CWN7 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cnot11Q9CWN7 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cnot11Q9CWN7 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cnot11Q9CWN7 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cnot11Q9CWN7 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cnot11Q9CWN7 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cnot11Q9CWN7 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cnot11Q9CWN7 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cnot11Q9CWN7 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cnot11Q9CWN7 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cnot11Q9CWN7 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cnot11Q9CWN7 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cnot11Q9CWN7 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cnot11Q9CWN7 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cnot11Q9CWN7 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cnot11Q9CWN7 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cnot11Q9CWN7 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Cnot11Q9CWN7 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Cnot11Q9CWN7 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Cnot11Q9CWN7 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cnot11Q9CWN7 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cnot11Q9CWN7 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cnot11Q9CWN7 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cnot11Q9CWN7 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cnot11Q9CWN7 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cnot11Q9CWN7 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cnot11Q9CWN7 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cnot11Q9CWN7 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cnot11Q9CWN7 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cnot11Q9CWN7 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cnot11Q9CWN7 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cnot11Q9CWN7 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cnot11Q9CWN7 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Cnot11Q9CWN7 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cnot11Q9CWN7 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cnot11Q9CWN7 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cnot11Q9CWN7 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cnot11Q9CWN7 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cnot11Q9CWN7 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cnot11Q9CWN7 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Cnot11Q9CWN7 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Cnot11Q9CWN7 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Cnot11Q9CWN7 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cnot11Q9CWN7 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cnot11Q9CWN7 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cnot11Q9CWN7 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cnot11Q9CWN7 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cnot11Q9CWN7 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cnot11Q9CWN7 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cnot11Q9CWN7 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cnot11Q9CWN7 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cnot11Q9CWN7 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cnot11Q9CWN7 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cnot11Q9CWN7 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnot11Q9CWN7 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnot11Q9CWN7 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnot11Q9CWN7 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnot11Q9CWN7 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnot11Q9CWN7 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnot11Q9CWN7 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnot11Q9CWN7 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnot11Q9CWN7 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnot11Q9CWN7 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnot11Q9CWN7 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Cnot11Q9CWN7 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnot11Q9CWN7 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnot11Q9CWN7 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnot11Q9CWN7 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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