Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWI3

Bccip, BRCA2 and CDKN1A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BccipQ9CWI3 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BccipQ9CWI3 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BccipQ9CWI3 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BccipQ9CWI3 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BccipQ9CWI3 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BccipQ9CWI3 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BccipQ9CWI3 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BccipQ9CWI3 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BccipQ9CWI3 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BccipQ9CWI3 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BccipQ9CWI3 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
BccipQ9CWI3 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BccipQ9CWI3 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BccipQ9CWI3 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BccipQ9CWI3 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BccipQ9CWI3 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
BccipQ9CWI3 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
BccipQ9CWI3 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BccipQ9CWI3 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BccipQ9CWI3 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BccipQ9CWI3 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BccipQ9CWI3 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BccipQ9CWI3 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BccipQ9CWI3 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BccipQ9CWI3 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BccipQ9CWI3 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BccipQ9CWI3 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BccipQ9CWI3 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BccipQ9CWI3 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BccipQ9CWI3 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BccipQ9CWI3 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BccipQ9CWI3 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BccipQ9CWI3 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BccipQ9CWI3 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BccipQ9CWI3 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BccipQ9CWI3 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BccipQ9CWI3 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BccipQ9CWI3 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BccipQ9CWI3 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BccipQ9CWI3 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BccipQ9CWI3 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BccipQ9CWI3 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BccipQ9CWI3 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BccipQ9CWI3 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BccipQ9CWI3 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BccipQ9CWI3 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BccipQ9CWI3 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BccipQ9CWI3 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BccipQ9CWI3 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BccipQ9CWI3 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BccipQ9CWI3 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BccipQ9CWI3 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BccipQ9CWI3 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BccipQ9CWI3 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
BccipQ9CWI3 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BccipQ9CWI3 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BccipQ9CWI3 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BccipQ9CWI3 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BccipQ9CWI3 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BccipQ9CWI3 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BccipQ9CWI3 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BccipQ9CWI3 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
BccipQ9CWI3 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BccipQ9CWI3 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BccipQ9CWI3 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BccipQ9CWI3 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BccipQ9CWI3 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BccipQ9CWI3 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BccipQ9CWI3 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BccipQ9CWI3 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BccipQ9CWI3 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BccipQ9CWI3 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BccipQ9CWI3 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BccipQ9CWI3 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BccipQ9CWI3 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BccipQ9CWI3 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BccipQ9CWI3 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BccipQ9CWI3 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BccipQ9CWI3 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BccipQ9CWI3 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BccipQ9CWI3 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BccipQ9CWI3 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BccipQ9CWI3 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BccipQ9CWI3 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BccipQ9CWI3 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BccipQ9CWI3 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BccipQ9CWI3 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
BccipQ9CWI3 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BccipQ9CWI3 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BccipQ9CWI3 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BccipQ9CWI3 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BccipQ9CWI3 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
BccipQ9CWI3 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BccipQ9CWI3 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BccipQ9CWI3 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BccipQ9CWI3 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BccipQ9CWI3 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BccipQ9CWI3 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BccipQ9CWI3 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BccipQ9CWI3 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms