Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pard3bQ9CSB4 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pard3bQ9CSB4 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pard3bQ9CSB4 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Pard3bQ9CSB4 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pard3bQ9CSB4 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pard3bQ9CSB4 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pard3bQ9CSB4 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pard3bQ9CSB4 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pard3bQ9CSB4 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pard3bQ9CSB4 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pard3bQ9CSB4 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pard3bQ9CSB4 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pard3bQ9CSB4 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pard3bQ9CSB4 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pard3bQ9CSB4 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pard3bQ9CSB4 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pard3bQ9CSB4 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pard3bQ9CSB4 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Pard3bQ9CSB4 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pard3bQ9CSB4 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pard3bQ9CSB4 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pard3bQ9CSB4 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Pard3bQ9CSB4 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pard3bQ9CSB4 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Pard3bQ9CSB4 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Pard3bQ9CSB4 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pard3bQ9CSB4 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Pard3bQ9CSB4 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pard3bQ9CSB4 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pard3bQ9CSB4 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pard3bQ9CSB4 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pard3bQ9CSB4 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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