Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms