Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP3

Chchd5, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd5Q9CQP3 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Chchd5Q9CQP3 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Chchd5Q9CQP3 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Chchd5Q9CQP3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Chchd5Q9CQP3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Chchd5Q9CQP3 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Chchd5Q9CQP3 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Chchd5Q9CQP3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Chchd5Q9CQP3 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Chchd5Q9CQP3 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Chchd5Q9CQP3 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Chchd5Q9CQP3 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Chchd5Q9CQP3 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Chchd5Q9CQP3 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Chchd5Q9CQP3 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Chchd5Q9CQP3 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Chchd5Q9CQP3 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Chchd5Q9CQP3 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Chchd5Q9CQP3 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Chchd5Q9CQP3 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Chchd5Q9CQP3 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Chchd5Q9CQP3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Chchd5Q9CQP3 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Chchd5Q9CQP3 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Chchd5Q9CQP3 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Chchd5Q9CQP3 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Chchd5Q9CQP3 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Chchd5Q9CQP3 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Chchd5Q9CQP3 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Chchd5Q9CQP3 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Chchd5Q9CQP3 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Chchd5Q9CQP3 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Chchd5Q9CQP3 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Chchd5Q9CQP3 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Chchd5Q9CQP3 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Chchd5Q9CQP3 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Chchd5Q9CQP3 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Chchd5Q9CQP3 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Chchd5Q9CQP3 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Chchd5Q9CQP3 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Chchd5Q9CQP3 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Chchd5Q9CQP3 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Chchd5Q9CQP3 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Chchd5Q9CQP3 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Chchd5Q9CQP3 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Chchd5Q9CQP3 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Chchd5Q9CQP3 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Chchd5Q9CQP3 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Chchd5Q9CQP3 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Chchd5Q9CQP3 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Chchd5Q9CQP3 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Chchd5Q9CQP3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Chchd5Q9CQP3 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Chchd5Q9CQP3 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Chchd5Q9CQP3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Chchd5Q9CQP3 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Chchd5Q9CQP3 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Chchd5Q9CQP3 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Chchd5Q9CQP3 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Chchd5Q9CQP3 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Chchd5Q9CQP3 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Chchd5Q9CQP3 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Chchd5Q9CQP3 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Chchd5Q9CQP3 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Chchd5Q9CQP3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Chchd5Q9CQP3 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Chchd5Q9CQP3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Chchd5Q9CQP3 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Chchd5Q9CQP3 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Chchd5Q9CQP3 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Chchd5Q9CQP3 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Chchd5Q9CQP3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Chchd5Q9CQP3 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Chchd5Q9CQP3 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Chchd5Q9CQP3 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Chchd5Q9CQP3 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Chchd5Q9CQP3 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Chchd5Q9CQP3 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Chchd5Q9CQP3 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Chchd5Q9CQP3 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Chchd5Q9CQP3 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Chchd5Q9CQP3 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Chchd5Q9CQP3 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Chchd5Q9CQP3 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Chchd5Q9CQP3 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Chchd5Q9CQP3 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Chchd5Q9CQP3 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Chchd5Q9CQP3 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Chchd5Q9CQP3 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Chchd5Q9CQP3 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Chchd5Q9CQP3 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Chchd5Q9CQP3 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Chchd5Q9CQP3 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Chchd5Q9CQP3 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Chchd5Q9CQP3 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Chchd5Q9CQP3 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Chchd5Q9CQP3 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Chchd5Q9CQP3 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Chchd5Q9CQP3 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Chchd5Q9CQP3 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms