Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccer1Q9CQL2 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccer1Q9CQL2 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccer1Q9CQL2 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccer1Q9CQL2 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccer1Q9CQL2 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccer1Q9CQL2 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccer1Q9CQL2 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccer1Q9CQL2 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccer1Q9CQL2 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccer1Q9CQL2 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccer1Q9CQL2 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccer1Q9CQL2 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccer1Q9CQL2 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccer1Q9CQL2 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccer1Q9CQL2 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccer1Q9CQL2 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccer1Q9CQL2 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccer1Q9CQL2 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccer1Q9CQL2 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccer1Q9CQL2 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccer1Q9CQL2 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccer1Q9CQL2 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccer1Q9CQL2 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccer1Q9CQL2 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccer1Q9CQL2 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccer1Q9CQL2 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccer1Q9CQL2 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccer1Q9CQL2 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccer1Q9CQL2 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccer1Q9CQL2 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccer1Q9CQL2 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccer1Q9CQL2 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccer1Q9CQL2 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccer1Q9CQL2 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccer1Q9CQL2 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccer1Q9CQL2 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccer1Q9CQL2 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccer1Q9CQL2 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccer1Q9CQL2 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccer1Q9CQL2 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccer1Q9CQL2 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccer1Q9CQL2 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccer1Q9CQL2 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccer1Q9CQL2 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccer1Q9CQL2 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccer1Q9CQL2 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccer1Q9CQL2 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccer1Q9CQL2 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccer1Q9CQL2 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccer1Q9CQL2 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms