Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE8

RTRAF, RNA transcription, translation and transport factor protein, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTRAFQ9CQE8 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
RTRAFQ9CQE8 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
RTRAFQ9CQE8 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
RTRAFQ9CQE8 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
RTRAFQ9CQE8 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
RTRAFQ9CQE8 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
RTRAFQ9CQE8 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RTRAFQ9CQE8 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RTRAFQ9CQE8 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RTRAFQ9CQE8 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RTRAFQ9CQE8 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RTRAFQ9CQE8 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RTRAFQ9CQE8 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RTRAFQ9CQE8 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RTRAFQ9CQE8 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RTRAFQ9CQE8 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RTRAFQ9CQE8 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RTRAFQ9CQE8 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RTRAFQ9CQE8 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RTRAFQ9CQE8 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RTRAFQ9CQE8 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RTRAFQ9CQE8 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RTRAFQ9CQE8 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RTRAFQ9CQE8 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RTRAFQ9CQE8 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RTRAFQ9CQE8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RTRAFQ9CQE8 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RTRAFQ9CQE8 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RTRAFQ9CQE8 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RTRAFQ9CQE8 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RTRAFQ9CQE8 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RTRAFQ9CQE8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RTRAFQ9CQE8 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RTRAFQ9CQE8 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RTRAFQ9CQE8 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RTRAFQ9CQE8 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RTRAFQ9CQE8 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RTRAFQ9CQE8 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RTRAFQ9CQE8 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RTRAFQ9CQE8 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RTRAFQ9CQE8 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RTRAFQ9CQE8 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RTRAFQ9CQE8 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RTRAFQ9CQE8 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RTRAFQ9CQE8 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RTRAFQ9CQE8 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RTRAFQ9CQE8 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RTRAFQ9CQE8 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RTRAFQ9CQE8 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RTRAFQ9CQE8 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RTRAFQ9CQE8 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RTRAFQ9CQE8 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RTRAFQ9CQE8 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RTRAFQ9CQE8 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RTRAFQ9CQE8 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RTRAFQ9CQE8 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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RTRAFQ9CQE8 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RTRAFQ9CQE8 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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RTRAFQ9CQE8 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RTRAFQ9CQE8 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RTRAFQ9CQE8 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
RTRAFQ9CQE8 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RTRAFQ9CQE8 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RTRAFQ9CQE8 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
RTRAFQ9CQE8 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
RTRAFQ9CQE8 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RTRAFQ9CQE8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RTRAFQ9CQE8 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RTRAFQ9CQE8 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RTRAFQ9CQE8 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RTRAFQ9CQE8 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RTRAFQ9CQE8 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RTRAFQ9CQE8 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RTRAFQ9CQE8 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RTRAFQ9CQE8 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RTRAFQ9CQE8 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RTRAFQ9CQE8 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RTRAFQ9CQE8 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RTRAFQ9CQE8 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RTRAFQ9CQE8 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RTRAFQ9CQE8 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RTRAFQ9CQE8 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RTRAFQ9CQE8 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RTRAFQ9CQE8 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RTRAFQ9CQE8 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RTRAFQ9CQE8 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RTRAFQ9CQE8 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RTRAFQ9CQE8 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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