Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE7

Ergic3, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ergic3Q9CQE7 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ergic3Q9CQE7 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ergic3Q9CQE7 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ergic3Q9CQE7 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ergic3Q9CQE7 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ergic3Q9CQE7 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ergic3Q9CQE7 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ergic3Q9CQE7 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ergic3Q9CQE7 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ergic3Q9CQE7 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ergic3Q9CQE7 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ergic3Q9CQE7 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ergic3Q9CQE7 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ergic3Q9CQE7 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ergic3Q9CQE7 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ergic3Q9CQE7 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ergic3Q9CQE7 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ergic3Q9CQE7 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ergic3Q9CQE7 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ergic3Q9CQE7 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ergic3Q9CQE7 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ergic3Q9CQE7 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ergic3Q9CQE7 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ergic3Q9CQE7 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ergic3Q9CQE7 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ergic3Q9CQE7 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ergic3Q9CQE7 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ergic3Q9CQE7 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ergic3Q9CQE7 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ergic3Q9CQE7 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ergic3Q9CQE7 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ergic3Q9CQE7 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ergic3Q9CQE7 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ergic3Q9CQE7 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ergic3Q9CQE7 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ergic3Q9CQE7 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ergic3Q9CQE7 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ergic3Q9CQE7 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ergic3Q9CQE7 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ergic3Q9CQE7 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ergic3Q9CQE7 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ergic3Q9CQE7 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ergic3Q9CQE7 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ergic3Q9CQE7 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ergic3Q9CQE7 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ergic3Q9CQE7 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ergic3Q9CQE7 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ergic3Q9CQE7 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ergic3Q9CQE7 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ergic3Q9CQE7 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ergic3Q9CQE7 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ergic3Q9CQE7 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ergic3Q9CQE7 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ergic3Q9CQE7 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ergic3Q9CQE7 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ergic3Q9CQE7 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ergic3Q9CQE7 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ergic3Q9CQE7 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ergic3Q9CQE7 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ergic3Q9CQE7 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ergic3Q9CQE7 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ergic3Q9CQE7 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ergic3Q9CQE7 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ergic3Q9CQE7 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ergic3Q9CQE7 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ergic3Q9CQE7 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ergic3Q9CQE7 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ergic3Q9CQE7 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ergic3Q9CQE7 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ergic3Q9CQE7 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ergic3Q9CQE7 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ergic3Q9CQE7 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ergic3Q9CQE7 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ergic3Q9CQE7 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ergic3Q9CQE7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ergic3Q9CQE7 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ergic3Q9CQE7 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ergic3Q9CQE7 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ergic3Q9CQE7 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ergic3Q9CQE7 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ergic3Q9CQE7 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ergic3Q9CQE7 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ergic3Q9CQE7 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ergic3Q9CQE7 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ergic3Q9CQE7 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ergic3Q9CQE7 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ergic3Q9CQE7 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ergic3Q9CQE7 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ergic3Q9CQE7 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ergic3Q9CQE7 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ergic3Q9CQE7 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ergic3Q9CQE7 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ergic3Q9CQE7 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ergic3Q9CQE7 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ergic3Q9CQE7 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ergic3Q9CQE7 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ergic3Q9CQE7 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ergic3Q9CQE7 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ergic3Q9CQE7 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ergic3Q9CQE7 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms