Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CQC3 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CQC3 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CQC3 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CQC3 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CQC3 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9CQC3 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9CQC3 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CQC3 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CQC3 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CQC3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CQC3 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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