Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

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Length 121 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Rpa3Q9CQ71 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpa3Q9CQ71 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms