Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Chmp3Q9CQ10 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Chmp3Q9CQ10 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Chmp3Q9CQ10 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Chmp3Q9CQ10 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Chmp3Q9CQ10 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Chmp3Q9CQ10 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Chmp3Q9CQ10 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Chmp3Q9CQ10 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Chmp3Q9CQ10 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Chmp3Q9CQ10 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Chmp3Q9CQ10 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Chmp3Q9CQ10 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Chmp3Q9CQ10 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Chmp3Q9CQ10 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Chmp3Q9CQ10 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Chmp3Q9CQ10 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Chmp3Q9CQ10 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Chmp3Q9CQ10 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Chmp3Q9CQ10 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Chmp3Q9CQ10 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Chmp3Q9CQ10 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Chmp3Q9CQ10 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Chmp3Q9CQ10 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Chmp3Q9CQ10 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Chmp3Q9CQ10 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Chmp3Q9CQ10 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Chmp3Q9CQ10 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Chmp3Q9CQ10 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Chmp3Q9CQ10 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Chmp3Q9CQ10 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Chmp3Q9CQ10 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Chmp3Q9CQ10 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Chmp3Q9CQ10 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Chmp3Q9CQ10 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Chmp3Q9CQ10 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Chmp3Q9CQ10 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Chmp3Q9CQ10 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Chmp3Q9CQ10 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Chmp3Q9CQ10 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Chmp3Q9CQ10 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Chmp3Q9CQ10 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Chmp3Q9CQ10 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Chmp3Q9CQ10 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms