Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms