Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPP0

Npm3, Nucleoplasmin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm3Q9CPP0 Gm3187-201ENSMUST00000178429 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Npm3Q9CPP0 Gm10338-202ENSMUST00000178623 612 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Npm3Q9CPP0 Gm8246-201ENSMUST00000179411 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Npm3Q9CPP0 Gm3012-202ENSMUST00000179486 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Npm3Q9CPP0 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Npm3Q9CPP0 Gm27861-201ENSMUST00000183920 214 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Npm3Q9CPP0 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Npm3Q9CPP0 Gm5717-201ENSMUST00000198243 1062 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Npm3Q9CPP0 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Npm3Q9CPP0 Gm44559-201ENSMUST00000207177 1012 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Npm3Q9CPP0 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Npm3Q9CPP0 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Npm3Q9CPP0 AC122924.1-201ENSMUST00000222044 163 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Npm3Q9CPP0 Reg2-201ENSMUST00000023906 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Npm3Q9CPP0 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Npm3Q9CPP0 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Npm3Q9CPP0 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Npm3Q9CPP0 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Npm3Q9CPP0 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Npm3Q9CPP0 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Npm3Q9CPP0 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Npm3Q9CPP0 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Npm3Q9CPP0 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Npm3Q9CPP0 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Npm3Q9CPP0 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Npm3Q9CPP0 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Npm3Q9CPP0 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Npm3Q9CPP0 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Npm3Q9CPP0 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Npm3Q9CPP0 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Npm3Q9CPP0 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Npm3Q9CPP0 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Npm3Q9CPP0 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Npm3Q9CPP0 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Npm3Q9CPP0 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Npm3Q9CPP0 Gm43771-201ENSMUST00000202931 1578 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Npm3Q9CPP0 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Npm3Q9CPP0 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Npm3Q9CPP0 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Npm3Q9CPP0 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Npm3Q9CPP0 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Npm3Q9CPP0 Gm4806-201ENSMUST00000222704 1690 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Npm3Q9CPP0 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Npm3Q9CPP0 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Npm3Q9CPP0 Mup-ps15-201ENSMUST00000121741 539 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Npm3Q9CPP0 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Npm3Q9CPP0 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Npm3Q9CPP0 Vmn1r18-201ENSMUST00000164732 1087 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Npm3Q9CPP0 AU040972-201ENSMUST00000165610 1042 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Npm3Q9CPP0 Gm28356-201ENSMUST00000186941 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Npm3Q9CPP0 1700010H22Rik-202ENSMUST00000187592 1003 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Npm3Q9CPP0 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Npm3Q9CPP0 AC122305.3-201ENSMUST00000214762 361 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Npm3Q9CPP0 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Npm3Q9CPP0 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Npm3Q9CPP0 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Npm3Q9CPP0 Lyrm2-201ENSMUST00000062802 465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Npm3Q9CPP0 Olfr926-201ENSMUST00000078289 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Npm3Q9CPP0 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Npm3Q9CPP0 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Npm3Q9CPP0 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Npm3Q9CPP0 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Npm3Q9CPP0 Il12a-201ENSMUST00000029345 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Npm3Q9CPP0 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Npm3Q9CPP0 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Npm3Q9CPP0 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Npm3Q9CPP0 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Npm3Q9CPP0 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Npm3Q9CPP0 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Npm3Q9CPP0 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Npm3Q9CPP0 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Npm3Q9CPP0 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Npm3Q9CPP0 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Npm3Q9CPP0 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Npm3Q9CPP0 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Npm3Q9CPP0 Prl2c1-202ENSMUST00000110335 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Npm3Q9CPP0 Cldn34d-201ENSMUST00000114054 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Npm3Q9CPP0 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Npm3Q9CPP0 Gm14746-201ENSMUST00000120309 741 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Npm3Q9CPP0 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Npm3Q9CPP0 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Npm3Q9CPP0 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Npm3Q9CPP0 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Npm3Q9CPP0 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Npm3Q9CPP0 Gm18356-201ENSMUST00000185677 623 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Npm3Q9CPP0 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Npm3Q9CPP0 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Npm3Q9CPP0 Gm38154-201ENSMUST00000195444 340 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Npm3Q9CPP0 Vmn1r2-202ENSMUST00000226198 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Npm3Q9CPP0 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Npm3Q9CPP0 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Npm3Q9CPP0 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Npm3Q9CPP0 Olfr812-201ENSMUST00000057775 1043 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Npm3Q9CPP0 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Npm3Q9CPP0 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Npm3Q9CPP0 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Npm3Q9CPP0 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Npm3Q9CPP0 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Npm3Q9CPP0 Prr27-201ENSMUST00000002310 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Npm3Q9CPP0 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms