Protein–RNA interactions for Protein: Q99P69

Nuf2, Kinetochore protein Nuf2, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nuf2Q99P69 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nuf2Q99P69 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nuf2Q99P69 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nuf2Q99P69 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nuf2Q99P69 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nuf2Q99P69 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nuf2Q99P69 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nuf2Q99P69 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nuf2Q99P69 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nuf2Q99P69 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nuf2Q99P69 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nuf2Q99P69 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nuf2Q99P69 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nuf2Q99P69 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nuf2Q99P69 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nuf2Q99P69 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nuf2Q99P69 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nuf2Q99P69 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nuf2Q99P69 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nuf2Q99P69 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nuf2Q99P69 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nuf2Q99P69 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nuf2Q99P69 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nuf2Q99P69 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nuf2Q99P69 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nuf2Q99P69 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nuf2Q99P69 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nuf2Q99P69 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nuf2Q99P69 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nuf2Q99P69 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nuf2Q99P69 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nuf2Q99P69 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nuf2Q99P69 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nuf2Q99P69 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nuf2Q99P69 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nuf2Q99P69 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nuf2Q99P69 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nuf2Q99P69 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nuf2Q99P69 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nuf2Q99P69 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nuf2Q99P69 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nuf2Q99P69 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nuf2Q99P69 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nuf2Q99P69 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nuf2Q99P69 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nuf2Q99P69 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nuf2Q99P69 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nuf2Q99P69 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nuf2Q99P69 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nuf2Q99P69 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nuf2Q99P69 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nuf2Q99P69 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nuf2Q99P69 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nuf2Q99P69 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nuf2Q99P69 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nuf2Q99P69 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nuf2Q99P69 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nuf2Q99P69 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nuf2Q99P69 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nuf2Q99P69 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nuf2Q99P69 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nuf2Q99P69 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nuf2Q99P69 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nuf2Q99P69 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nuf2Q99P69 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nuf2Q99P69 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nuf2Q99P69 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nuf2Q99P69 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nuf2Q99P69 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nuf2Q99P69 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nuf2Q99P69 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nuf2Q99P69 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nuf2Q99P69 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nuf2Q99P69 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nuf2Q99P69 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nuf2Q99P69 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nuf2Q99P69 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nuf2Q99P69 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nuf2Q99P69 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nuf2Q99P69 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nuf2Q99P69 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nuf2Q99P69 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nuf2Q99P69 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nuf2Q99P69 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nuf2Q99P69 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Nuf2Q99P69 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nuf2Q99P69 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Nuf2Q99P69 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nuf2Q99P69 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nuf2Q99P69 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nuf2Q99P69 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Nuf2Q99P69 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nuf2Q99P69 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nuf2Q99P69 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nuf2Q99P69 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nuf2Q99P69 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nuf2Q99P69 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Nuf2Q99P69 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nuf2Q99P69 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nuf2Q99P69 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms