Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA2

Atoh8, Protein atonal homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh8Q99NA2 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atoh8Q99NA2 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atoh8Q99NA2 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atoh8Q99NA2 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atoh8Q99NA2 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atoh8Q99NA2 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atoh8Q99NA2 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atoh8Q99NA2 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atoh8Q99NA2 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atoh8Q99NA2 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atoh8Q99NA2 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atoh8Q99NA2 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atoh8Q99NA2 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atoh8Q99NA2 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atoh8Q99NA2 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atoh8Q99NA2 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atoh8Q99NA2 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atoh8Q99NA2 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atoh8Q99NA2 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atoh8Q99NA2 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atoh8Q99NA2 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atoh8Q99NA2 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atoh8Q99NA2 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atoh8Q99NA2 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Atoh8Q99NA2 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atoh8Q99NA2 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atoh8Q99NA2 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atoh8Q99NA2 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Atoh8Q99NA2 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atoh8Q99NA2 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atoh8Q99NA2 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atoh8Q99NA2 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atoh8Q99NA2 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atoh8Q99NA2 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atoh8Q99NA2 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atoh8Q99NA2 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atoh8Q99NA2 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atoh8Q99NA2 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atoh8Q99NA2 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atoh8Q99NA2 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atoh8Q99NA2 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atoh8Q99NA2 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atoh8Q99NA2 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atoh8Q99NA2 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Atoh8Q99NA2 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atoh8Q99NA2 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atoh8Q99NA2 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atoh8Q99NA2 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atoh8Q99NA2 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atoh8Q99NA2 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atoh8Q99NA2 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atoh8Q99NA2 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atoh8Q99NA2 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atoh8Q99NA2 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atoh8Q99NA2 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atoh8Q99NA2 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atoh8Q99NA2 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atoh8Q99NA2 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
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Atoh8Q99NA2 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atoh8Q99NA2 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Atoh8Q99NA2 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atoh8Q99NA2 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atoh8Q99NA2 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atoh8Q99NA2 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Atoh8Q99NA2 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atoh8Q99NA2 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atoh8Q99NA2 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atoh8Q99NA2 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atoh8Q99NA2 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atoh8Q99NA2 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Atoh8Q99NA2 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atoh8Q99NA2 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atoh8Q99NA2 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atoh8Q99NA2 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atoh8Q99NA2 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atoh8Q99NA2 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atoh8Q99NA2 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atoh8Q99NA2 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atoh8Q99NA2 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atoh8Q99NA2 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atoh8Q99NA2 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atoh8Q99NA2 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atoh8Q99NA2 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atoh8Q99NA2 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atoh8Q99NA2 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atoh8Q99NA2 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atoh8Q99NA2 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atoh8Q99NA2 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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