Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brms1Q99N20 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms