Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Hdac9Q99N13 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hdac9Q99N13 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hdac9Q99N13 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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