Protein–RNA interactions for Protein: Q99N08

Ms4a6c, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6C, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6cQ99N08 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a6cQ99N08 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms