Protein–RNA interactions for Protein: Q99MW3

Pramel1, Preferentially expressed antigen in melanoma-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel1Q99MW3 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pramel1Q99MW3 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pramel1Q99MW3 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pramel1Q99MW3 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pramel1Q99MW3 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pramel1Q99MW3 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pramel1Q99MW3 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pramel1Q99MW3 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pramel1Q99MW3 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pramel1Q99MW3 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pramel1Q99MW3 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pramel1Q99MW3 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pramel1Q99MW3 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pramel1Q99MW3 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pramel1Q99MW3 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pramel1Q99MW3 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pramel1Q99MW3 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pramel1Q99MW3 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pramel1Q99MW3 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pramel1Q99MW3 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pramel1Q99MW3 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pramel1Q99MW3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pramel1Q99MW3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pramel1Q99MW3 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pramel1Q99MW3 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pramel1Q99MW3 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pramel1Q99MW3 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pramel1Q99MW3 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pramel1Q99MW3 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pramel1Q99MW3 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pramel1Q99MW3 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pramel1Q99MW3 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pramel1Q99MW3 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pramel1Q99MW3 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pramel1Q99MW3 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pramel1Q99MW3 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pramel1Q99MW3 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pramel1Q99MW3 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramel1Q99MW3 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramel1Q99MW3 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramel1Q99MW3 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramel1Q99MW3 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramel1Q99MW3 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramel1Q99MW3 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramel1Q99MW3 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramel1Q99MW3 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramel1Q99MW3 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramel1Q99MW3 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramel1Q99MW3 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramel1Q99MW3 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramel1Q99MW3 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramel1Q99MW3 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramel1Q99MW3 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramel1Q99MW3 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramel1Q99MW3 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramel1Q99MW3 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramel1Q99MW3 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramel1Q99MW3 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramel1Q99MW3 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramel1Q99MW3 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramel1Q99MW3 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramel1Q99MW3 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramel1Q99MW3 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramel1Q99MW3 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramel1Q99MW3 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramel1Q99MW3 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramel1Q99MW3 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramel1Q99MW3 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramel1Q99MW3 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramel1Q99MW3 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pramel1Q99MW3 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pramel1Q99MW3 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Pramel1Q99MW3 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pramel1Q99MW3 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pramel1Q99MW3 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms