Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tdrd1Q99MV1 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms