Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PtprtQ99M80 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtprtQ99M80 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms