Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gps1Q99LD4 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gps1Q99LD4 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gps1Q99LD4 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gps1Q99LD4 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms