Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pagr1aQ99L02 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms