Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY6

Higd1b, HIG1 domain family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1bQ99JY6 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd1bQ99JY6 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms