Protein–RNA interactions for Protein: Q99JI4

Psmd6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd6Q99JI4 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms