Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Pacsin3Q99JB8 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms