Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ddb2Q99J79 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ddb2Q99J79 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ddb2Q99J79 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ddb2Q99J79 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ddb2Q99J79 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ddb2Q99J79 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Ddb2Q99J79 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Ddb2Q99J79 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Ddb2Q99J79 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ddb2Q99J79 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Ddb2Q99J79 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Ddb2Q99J79 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Ddb2Q99J79 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ddb2Q99J79 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ddb2Q99J79 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ddb2Q99J79 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Ddb2Q99J79 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ddb2Q99J79 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Ddb2Q99J79 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
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