Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms