Protein–RNA interactions for Protein: Q99J38

Ttc30a1, Tetratricopeptide repeat protein 30A1, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc30a1Q99J38 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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Ttc30a1Q99J38 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc30a1Q99J38 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Ttc30a1Q99J38 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc30a1Q99J38 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Ttc30a1Q99J38 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ttc30a1Q99J38 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ttc30a1Q99J38 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ttc30a1Q99J38 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ttc30a1Q99J38 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ttc30a1Q99J38 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ttc30a1Q99J38 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc30a1Q99J38 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc30a1Q99J38 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc30a1Q99J38 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc30a1Q99J38 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc30a1Q99J38 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc30a1Q99J38 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc30a1Q99J38 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc30a1Q99J38 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc30a1Q99J38 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc30a1Q99J38 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc30a1Q99J38 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc30a1Q99J38 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc30a1Q99J38 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc30a1Q99J38 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc30a1Q99J38 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc30a1Q99J38 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc30a1Q99J38 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc30a1Q99J38 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc30a1Q99J38 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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