Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
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Smim11aQ99J19 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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Smim11aQ99J19 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Smim11aQ99J19 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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