Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csmd1Q923L3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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