Protein–RNA interactions for Protein: Q922L6

Nelfcd, Negative elongation factor D, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfcdQ922L6 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NelfcdQ922L6 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NelfcdQ922L6 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NelfcdQ922L6 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NelfcdQ922L6 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NelfcdQ922L6 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NelfcdQ922L6 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NelfcdQ922L6 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NelfcdQ922L6 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NelfcdQ922L6 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NelfcdQ922L6 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NelfcdQ922L6 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NelfcdQ922L6 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NelfcdQ922L6 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NelfcdQ922L6 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NelfcdQ922L6 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NelfcdQ922L6 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NelfcdQ922L6 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NelfcdQ922L6 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NelfcdQ922L6 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NelfcdQ922L6 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NelfcdQ922L6 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NelfcdQ922L6 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NelfcdQ922L6 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NelfcdQ922L6 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NelfcdQ922L6 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NelfcdQ922L6 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NelfcdQ922L6 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NelfcdQ922L6 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NelfcdQ922L6 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NelfcdQ922L6 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NelfcdQ922L6 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NelfcdQ922L6 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NelfcdQ922L6 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NelfcdQ922L6 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NelfcdQ922L6 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NelfcdQ922L6 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NelfcdQ922L6 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NelfcdQ922L6 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NelfcdQ922L6 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NelfcdQ922L6 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NelfcdQ922L6 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NelfcdQ922L6 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NelfcdQ922L6 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NelfcdQ922L6 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NelfcdQ922L6 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
NelfcdQ922L6 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NelfcdQ922L6 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NelfcdQ922L6 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NelfcdQ922L6 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NelfcdQ922L6 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NelfcdQ922L6 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
NelfcdQ922L6 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NelfcdQ922L6 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NelfcdQ922L6 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
NelfcdQ922L6 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
NelfcdQ922L6 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
NelfcdQ922L6 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NelfcdQ922L6 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NelfcdQ922L6 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NelfcdQ922L6 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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NelfcdQ922L6 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NelfcdQ922L6 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NelfcdQ922L6 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NelfcdQ922L6 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NelfcdQ922L6 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NelfcdQ922L6 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NelfcdQ922L6 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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NelfcdQ922L6 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NelfcdQ922L6 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NelfcdQ922L6 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NelfcdQ922L6 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NelfcdQ922L6 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NelfcdQ922L6 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NelfcdQ922L6 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NelfcdQ922L6 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NelfcdQ922L6 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NelfcdQ922L6 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NelfcdQ922L6 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NelfcdQ922L6 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NelfcdQ922L6 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NelfcdQ922L6 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NelfcdQ922L6 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NelfcdQ922L6 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NelfcdQ922L6 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NelfcdQ922L6 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NelfcdQ922L6 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NelfcdQ922L6 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NelfcdQ922L6 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NelfcdQ922L6 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NelfcdQ922L6 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NelfcdQ922L6 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NelfcdQ922L6 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NelfcdQ922L6 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NelfcdQ922L6 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NelfcdQ922L6 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NelfcdQ922L6 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NelfcdQ922L6 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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