Protein–RNA interactions for Protein: Q922B6

Traf7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf7Q922B6 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Traf7Q922B6 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Traf7Q922B6 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf7Q922B6 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Traf7Q922B6 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Traf7Q922B6 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf7Q922B6 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf7Q922B6 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf7Q922B6 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf7Q922B6 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf7Q922B6 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf7Q922B6 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Traf7Q922B6 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Traf7Q922B6 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf7Q922B6 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf7Q922B6 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Traf7Q922B6 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf7Q922B6 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Traf7Q922B6 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Traf7Q922B6 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf7Q922B6 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf7Q922B6 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf7Q922B6 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Traf7Q922B6 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf7Q922B6 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf7Q922B6 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf7Q922B6 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf7Q922B6 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf7Q922B6 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf7Q922B6 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf7Q922B6 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf7Q922B6 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf7Q922B6 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf7Q922B6 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf7Q922B6 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Traf7Q922B6 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms