Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK2

Rrp1b, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1bQ91YK2 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rrp1bQ91YK2 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rrp1bQ91YK2 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rrp1bQ91YK2 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rrp1bQ91YK2 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rrp1bQ91YK2 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rrp1bQ91YK2 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rrp1bQ91YK2 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp1bQ91YK2 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp1bQ91YK2 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp1bQ91YK2 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp1bQ91YK2 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp1bQ91YK2 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp1bQ91YK2 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp1bQ91YK2 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp1bQ91YK2 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp1bQ91YK2 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp1bQ91YK2 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp1bQ91YK2 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp1bQ91YK2 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp1bQ91YK2 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp1bQ91YK2 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp1bQ91YK2 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp1bQ91YK2 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp1bQ91YK2 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp1bQ91YK2 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp1bQ91YK2 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp1bQ91YK2 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp1bQ91YK2 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp1bQ91YK2 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp1bQ91YK2 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp1bQ91YK2 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp1bQ91YK2 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp1bQ91YK2 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp1bQ91YK2 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp1bQ91YK2 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp1bQ91YK2 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp1bQ91YK2 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp1bQ91YK2 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp1bQ91YK2 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp1bQ91YK2 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp1bQ91YK2 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp1bQ91YK2 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp1bQ91YK2 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp1bQ91YK2 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp1bQ91YK2 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp1bQ91YK2 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp1bQ91YK2 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp1bQ91YK2 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp1bQ91YK2 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp1bQ91YK2 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp1bQ91YK2 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp1bQ91YK2 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp1bQ91YK2 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp1bQ91YK2 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp1bQ91YK2 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp1bQ91YK2 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp1bQ91YK2 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp1bQ91YK2 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp1bQ91YK2 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp1bQ91YK2 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp1bQ91YK2 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp1bQ91YK2 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp1bQ91YK2 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp1bQ91YK2 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp1bQ91YK2 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp1bQ91YK2 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp1bQ91YK2 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp1bQ91YK2 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp1bQ91YK2 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp1bQ91YK2 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp1bQ91YK2 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp1bQ91YK2 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp1bQ91YK2 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp1bQ91YK2 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp1bQ91YK2 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp1bQ91YK2 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp1bQ91YK2 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp1bQ91YK2 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp1bQ91YK2 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp1bQ91YK2 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp1bQ91YK2 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp1bQ91YK2 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp1bQ91YK2 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp1bQ91YK2 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms