Protein–RNA interactions for Protein: Q91XD6

Vps36, Vacuolar protein-sorting-associated protein 36, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps36Q91XD6 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps36Q91XD6 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps36Q91XD6 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms