Protein–RNA interactions for Protein: Q91VH2

Snx9, Sorting nexin-9, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx9Q91VH2 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx9Q91VH2 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx9Q91VH2 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx9Q91VH2 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx9Q91VH2 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx9Q91VH2 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx9Q91VH2 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx9Q91VH2 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx9Q91VH2 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx9Q91VH2 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx9Q91VH2 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx9Q91VH2 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snx9Q91VH2 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snx9Q91VH2 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snx9Q91VH2 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snx9Q91VH2 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snx9Q91VH2 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx9Q91VH2 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx9Q91VH2 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx9Q91VH2 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx9Q91VH2 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Snx9Q91VH2 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Snx9Q91VH2 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx9Q91VH2 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Snx9Q91VH2 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Snx9Q91VH2 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx9Q91VH2 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Snx9Q91VH2 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Snx9Q91VH2 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Snx9Q91VH2 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Snx9Q91VH2 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Snx9Q91VH2 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Snx9Q91VH2 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Snx9Q91VH2 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Snx9Q91VH2 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx9Q91VH2 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx9Q91VH2 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx9Q91VH2 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Snx9Q91VH2 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx9Q91VH2 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx9Q91VH2 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Snx9Q91VH2 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx9Q91VH2 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx9Q91VH2 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx9Q91VH2 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx9Q91VH2 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx9Q91VH2 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx9Q91VH2 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Snx9Q91VH2 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx9Q91VH2 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx9Q91VH2 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Snx9Q91VH2 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx9Q91VH2 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx9Q91VH2 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx9Q91VH2 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx9Q91VH2 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx9Q91VH2 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx9Q91VH2 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Snx9Q91VH2 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx9Q91VH2 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx9Q91VH2 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx9Q91VH2 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Snx9Q91VH2 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx9Q91VH2 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx9Q91VH2 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx9Q91VH2 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx9Q91VH2 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx9Q91VH2 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx9Q91VH2 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx9Q91VH2 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx9Q91VH2 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx9Q91VH2 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx9Q91VH2 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx9Q91VH2 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx9Q91VH2 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx9Q91VH2 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx9Q91VH2 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx9Q91VH2 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx9Q91VH2 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx9Q91VH2 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Snx9Q91VH2 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx9Q91VH2 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx9Q91VH2 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx9Q91VH2 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx9Q91VH2 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx9Q91VH2 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx9Q91VH2 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx9Q91VH2 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx9Q91VH2 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx9Q91VH2 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx9Q91VH2 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx9Q91VH2 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx9Q91VH2 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Snx9Q91VH2 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Snx9Q91VH2 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx9Q91VH2 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx9Q91VH2 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx9Q91VH2 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx9Q91VH2 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx9Q91VH2 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms