Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS4

Rprd1a, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1aQ8VDS4 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Rprd1aQ8VDS4 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rprd1aQ8VDS4 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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