Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDF2

Uhrf1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Uhrf1Q8VDF2 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Uhrf1Q8VDF2 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Uhrf1Q8VDF2 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Uhrf1Q8VDF2 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Uhrf1Q8VDF2 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Uhrf1Q8VDF2 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Uhrf1Q8VDF2 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Uhrf1Q8VDF2 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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Uhrf1Q8VDF2 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Uhrf1Q8VDF2 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Uhrf1Q8VDF2 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Uhrf1Q8VDF2 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Uhrf1Q8VDF2 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Uhrf1Q8VDF2 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Uhrf1Q8VDF2 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Uhrf1Q8VDF2 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Uhrf1Q8VDF2 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Uhrf1Q8VDF2 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Uhrf1Q8VDF2 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Uhrf1Q8VDF2 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Uhrf1Q8VDF2 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Uhrf1Q8VDF2 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Uhrf1Q8VDF2 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Uhrf1Q8VDF2 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Uhrf1Q8VDF2 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Uhrf1Q8VDF2 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Uhrf1Q8VDF2 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Uhrf1Q8VDF2 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Uhrf1Q8VDF2 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Uhrf1Q8VDF2 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Uhrf1Q8VDF2 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Uhrf1Q8VDF2 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Uhrf1Q8VDF2 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Uhrf1Q8VDF2 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Uhrf1Q8VDF2 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Uhrf1Q8VDF2 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Uhrf1Q8VDF2 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Uhrf1Q8VDF2 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Uhrf1Q8VDF2 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Uhrf1Q8VDF2 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Uhrf1Q8VDF2 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Uhrf1Q8VDF2 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Uhrf1Q8VDF2 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Uhrf1Q8VDF2 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Uhrf1Q8VDF2 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Uhrf1Q8VDF2 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Uhrf1Q8VDF2 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Uhrf1Q8VDF2 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Uhrf1Q8VDF2 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Uhrf1Q8VDF2 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Uhrf1Q8VDF2 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Uhrf1Q8VDF2 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Uhrf1Q8VDF2 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Uhrf1Q8VDF2 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Uhrf1Q8VDF2 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Uhrf1Q8VDF2 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Uhrf1Q8VDF2 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
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