Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC66

Ssx2ip, Afadin- and alpha-actinin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx2ipQ8VC66 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms