Protein–RNA interactions for Protein: Q8R332

Nup58, Nucleoporin p58/p45, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup58Q8R332 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup58Q8R332 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup58Q8R332 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup58Q8R332 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup58Q8R332 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup58Q8R332 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup58Q8R332 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup58Q8R332 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup58Q8R332 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup58Q8R332 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup58Q8R332 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup58Q8R332 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup58Q8R332 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup58Q8R332 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup58Q8R332 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup58Q8R332 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup58Q8R332 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup58Q8R332 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup58Q8R332 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup58Q8R332 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup58Q8R332 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup58Q8R332 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup58Q8R332 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup58Q8R332 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup58Q8R332 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup58Q8R332 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup58Q8R332 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup58Q8R332 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup58Q8R332 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup58Q8R332 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup58Q8R332 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup58Q8R332 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup58Q8R332 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup58Q8R332 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup58Q8R332 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup58Q8R332 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup58Q8R332 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup58Q8R332 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup58Q8R332 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup58Q8R332 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup58Q8R332 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup58Q8R332 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup58Q8R332 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup58Q8R332 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup58Q8R332 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup58Q8R332 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup58Q8R332 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup58Q8R332 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup58Q8R332 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup58Q8R332 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup58Q8R332 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup58Q8R332 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup58Q8R332 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup58Q8R332 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup58Q8R332 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup58Q8R332 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup58Q8R332 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup58Q8R332 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup58Q8R332 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup58Q8R332 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup58Q8R332 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup58Q8R332 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup58Q8R332 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup58Q8R332 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup58Q8R332 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup58Q8R332 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup58Q8R332 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup58Q8R332 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup58Q8R332 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup58Q8R332 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup58Q8R332 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup58Q8R332 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup58Q8R332 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup58Q8R332 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup58Q8R332 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup58Q8R332 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup58Q8R332 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup58Q8R332 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup58Q8R332 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup58Q8R332 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup58Q8R332 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup58Q8R332 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup58Q8R332 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup58Q8R332 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup58Q8R332 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup58Q8R332 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup58Q8R332 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup58Q8R332 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup58Q8R332 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup58Q8R332 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup58Q8R332 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup58Q8R332 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup58Q8R332 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup58Q8R332 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup58Q8R332 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup58Q8R332 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup58Q8R332 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup58Q8R332 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup58Q8R332 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup58Q8R332 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms