Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OptnQ8K3K8 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms