Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MyripQ8K3I4 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms