Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2M3

Srrd, SRR1-like protein, mousemouse

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Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrdQ8K2M3 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SrrdQ8K2M3 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SrrdQ8K2M3 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrrdQ8K2M3 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrrdQ8K2M3 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrrdQ8K2M3 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SrrdQ8K2M3 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrrdQ8K2M3 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrrdQ8K2M3 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrrdQ8K2M3 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrrdQ8K2M3 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrrdQ8K2M3 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrrdQ8K2M3 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrrdQ8K2M3 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrrdQ8K2M3 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrrdQ8K2M3 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrrdQ8K2M3 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrrdQ8K2M3 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrrdQ8K2M3 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrrdQ8K2M3 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrrdQ8K2M3 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrrdQ8K2M3 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrrdQ8K2M3 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrrdQ8K2M3 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrrdQ8K2M3 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrrdQ8K2M3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrrdQ8K2M3 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SrrdQ8K2M3 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SrrdQ8K2M3 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
SrrdQ8K2M3 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SrrdQ8K2M3 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SrrdQ8K2M3 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SrrdQ8K2M3 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SrrdQ8K2M3 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SrrdQ8K2M3 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SrrdQ8K2M3 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms