Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms