Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms