Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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